Код счетчика у нас лежит в отдельном файле с которым удобно работать. Если нужно отредактировать, то это можно сделать в одном месте и изменения будут во всех шаблонах где этот код присутствует
В нужных шаблонах проставляем код после открывающего тега head: <?$APPLICATION->IncludeFile(SITE_DIR."include/counter.php");?>
Переходим в папку Include.
На компьютере заранее создаем текстовый файл с кодом метрики и назваем его counter.php. Или же можно это сделать из админки Битрикса. Выгружаем или создаем файл в папке